國史館為中華民國國家歷史最高編纂機構，主要負責國家重要史料、檔案與珍貴文物的典藏、整理、研究與應用。

國家檔案館是國家發展委員會檔案管理局設置的一個承載國家記憶的重要場域，檔管局為中華民國檔案管理的最高主管機關，負責整合與保存國家重要檔案與歷史記憶。

國際敦煌項目 (International Dunhuang Programme, IDP) 創立於 1994 年，是一項具開創性的國際合作計畫。其核心目標是透過數位化手段，將散落於世界各地的絲綢之路東段（包含敦煌、吐魯番、黑水城等）的文獻、手稿、繪畫、紡織品及文物整合於線上，以促進全球學者與大眾對該區域歷史與文化的理解。

中國數字方志庫是專門收錄中國歷代地方志（方志）的大型古籍數位化數據庫，為歷史、地理、社會學及民俗學等研究提供核心的文獻支持。

臺灣學數位圖書館整合了豐富的日治時期珍貴文獻，大量地方方志、官方施政史料與原住民研究，以及東南亞政治與經濟的調查，以及記錄庶民生活與重大工程的臺灣寫真帖。

台灣歷史數位圖書館 (THDL) 是一個整合台灣史第一手史料的全文資料庫，收藏超過十萬筆涵蓋淡新檔案、行政文書及古契書的珍貴文獻。

繙云文獻，根據中國不同省份及主要區域，按一定體例記載分時各區的自然、社會、政經、文化等方面的書籍文獻，收錄地方志之刊本時間，起於宋元迄於民國初期。其內容不僅包括各地區的疆域、氣候、山川、物產等地理資料，也涵蓋人文歷史各方面的記載，如戶口、人物、賦稅、藝文等，為中國各地區省份之綜合性百科全書。研究地方志可藉此了解不同時期、區域的政經社會等變遷。

由國立臺灣大學圖書館維運的臺灣日治時期統計資料庫，以國立臺灣大學圖書館及國立中央圖書館臺灣分館(現名國立臺灣圖書館)所典藏的日治統計舊籍為收錄對象，共收錄681冊日治時期統計出版品，建置19萬4,075頁數位化影像檔案，10萬3,732筆詮釋資料，其中包括書名、表格名稱、統計年份、出版單位等重要資訊，並製作成可供查詢及瀏覽之資料庫。

國立臺灣大學圖書館與哈佛燕京圖書館在2015年簽署合作協議，建立一個聯合數位資源平臺，整合了兩校豐富的館藏，涵蓋中文善本古籍、清代檔案及日治時期臺灣的珍貴史料。使用者可以透過此網站存取多樣化的媒介，包含歷史地圖、老照片、拓片以及珍貴的手稿與音訊資料。